绿荫环绕的海藏寺位于扇谷最深处，是临济宗建长寺派的寺院。原本属于真言宗，1153年（建长5年）奉宗尊亲王之命，以藤原仲能为发起人，重新修建了七堂伽蓝。但是，1333年（元弘3年）镰仓幕府灭亡时，七堂伽蓝在战火中烧毁，1394年（应永元年），奉第二代镰仓公方（室町幕府设立的驻外机关镰仓府的长官）足利氏满之命，由上杉氏定将其作为禅宗寺院进行了重建。初代住持是以谣曲（日本传统艺术“能”的剧本）《杀生石》而闻名的心昭空外（源翁禅师），后来又得到扇谷上杉氏的支持与保护。根据1791年（宽政3年）的寺院境内图来看，当时主要的伽蓝配置和现在基本相同，图上还描绘了塔头七院。

佛殿（药师堂）于1775年（安永5年）从净智寺迁移而来，其中供奉着药师像的脸部藏于佛像内部的药师如来像（别名啼药师）和十二神将像等。寺院门前有底脱之井（镰仓十井之一），寺院境内南侧的石窟中有十六之井。

这里四季均有鲜花盛开，也是镰仓为数不多的著名“花之寺”。春季的海棠、夏季的凌霄、初秋的胡枝子和初春的梅花尤其值得一看。正殿后方有一座经过精心维护的回游式庭园，但未面向公众开放。

海藏寺是镰仓三十三观音第26番和镰仓二十四地藏第15番。